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“雲上(shàng)黑(hēi)山(shān)羊”基因身份證和(hé)50K育種芯片研發成功提
2024/5/11
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記者近日從雲南省科技(jì)廳了解到,省畜牧獸醫(yī)科學院羊産業技(jì)術(shù)研發與應用創新團隊成功研發出“雲上(shàng)黑(hēi)山(shān)羊基因身份證”和(hé)“雲上(shàng)黑(hēi)山(shān)羊50K育種芯片”,可(kě)用于“雲上(shàng)黑(hēi)山(shān)羊”的精準鑒定,并提高(gāo)其精準育種水(shuǐ)平和(hé)育種效率。研發成果将為(wèi)規範“雲上(shàng)黑(hēi)山(shān)羊”種羊推廣、提高(gāo)種質價值、開(kāi)展持續選育提供技(jì)術(shù)支撐,助推雲南省肉羊産業高(gāo)質量發展。
為(wèi)鑒定“雲上(shàng)黑(hēi)山(shān)羊”純種,有(yǒu)效開(kāi)展種業市場(chǎng)監管,維護其品牌價值,省畜牧獸醫(yī)科學院研究團隊對我國南方主要的4個(gè)黑(hēi)山(shān)羊品種(類群)160隻個(gè)體(tǐ)進行(xíng)深度基因組重測序獲取各品種特異性位點後,對3072個(gè)樣本進行(xíng)分型檢測,借助機器(qì)學習方法建立了“雲上(shàng)黑(hēi)山(shān)羊”鑒定模型并完成模型的優化,挖掘出能夠作(zuò)為(wèi)純種“雲上(shàng)黑(hēi)山(shān)羊”基因标識鑒定的26個(gè)SNP位點,終研發出“雲上(shàng)黑(hēi)山(shān)羊基因身份證”。目前該基因身份證鑒定成功率達90%,是國內(nèi)開(kāi)展“雲上(shàng)黑(hēi)山(shān)羊”品種鑒定的試劑盒。
“雲上(shàng)黑(hēi)山(shān)羊50K育種芯片”基于山(shān)羊通(tōng)用芯片功能位點,融合了74個(gè)“雲上(shàng)黑(hēi)山(shān)羊”繁殖性狀、生(shēng)長性狀和(hé)基因身份證的功能位點共計(jì)50000個(gè)SNP位點,平均檢出率可(kě)達98.77%,分型一緻性可(kě)達99.30%,相較于通(tōng)用芯片檢測成本降低(dī)了三成。該芯片不但(dàn)可(kě)用于“雲上(shàng)黑(hēi)山(shān)羊”全基因組選擇育種、重要經濟性狀功能基因挖掘,還(hái)可(kě)用于雲南本地山(shān)羊種質資源創新利用與保護、親緣關系鑒定等,是目前國內(nèi)一款“雲上(shàng)黑(hēi)山(shān)羊”育種芯片,相較通(tōng)用芯片,在降低(dī)分子育種成本、提高(gāo)選種準确率方面優勢明(míng)顯。
“雲上(shàng)黑(hēi)山(shān)羊”是由省畜牧獸醫(yī)科學院聯合省內(nèi)多(duō)家(jiā)單位曆時(shí)22年培育的我國個(gè)肉用黑(hēi)山(shān)羊新品種。2023年6月,該品種被農業農村部列為(wèi)全國主導品種。近10年來(lái),科研團隊聯合企業加大(dà)成果轉化應用力度,在全國20餘個(gè)省(區(qū)、市)和(hé)雲南省120個(gè)縣(市、區(qū))累計(jì)推廣“雲上(shàng)黑(hēi)山(shān)羊”種羊15萬餘隻,獲綜合經濟效益300多(duō)億元。雲南省內(nèi)覆蓋面達93%,占全省山(shān)羊種羊市場(chǎng)的94%,累計(jì)帶動1.5萬戶群衆增收緻富。
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